Die DSTG organisiert sich in den einzelnen Hamburger Finanzämtern in Ortsverbänden. In den Ortsverbänden existieren entsprechende Vorstände, die die Mitgliederinteressen vertreten und in der Organisation der DSTG voranbringen. Die Vorsitzenden der Ortsverbände bilden den Hauptvorstand der DSTG Hamburg, dem höchsten Entscheidungsgremium zwischen den Gewerkschaftstagen.